Pour la grande majorité des animaux terrestres, le parapentiste est identifié comme un très grand prédateur et induit un comportement de panique et de fuite.
Aussi, de manière générale, ne survolez pas les hardes de chamois, de bouquetins ou d’autres ongulés. Au-delà de l’impressionnant spectacle que fourni la débandade de ces animaux, cette fuite provoque un stress majeur pouvant induire des avortements chez les mères, la perte des jeunes, des blessures ou la mort. En 1999, dans les Bauges, une harde de chamois ainsi survolée par un parapente, a déroché et induit la mort de 2 animaux.
Cette peur est également présente chez la petite faune de montagne, tétras lyre, lagopède, lièvre variable et même la marmotte qui, après avoir poussé un unique cri strident se réfugie au fond de son terrier, où elle peut rester terrée plusieurs heures, sans se nourrir ni constituer ses réserves hivernales.

Toutes les manoeuvres d’approches d’un parapente par les rapaces ne sont jamais des jeux mais toujours, dans un premier temps, une évaluation du danger puis, dans un second temps, des tentatives d’intimidations pouvant être plus ou moins prononcées. Le vol en festons de l’aigle royal (suite rapide de piqués et de chandelles) est ainsi un comportement typiquement territorial, il cherche à chasser l’intrus. Le parapente est alors entré dans une zone sensible pour l’oiseau, le plus souvent il défend son nid et ses environs immédiats, ce que l’on appelle sa "chambre nuptiale". Afin de le laisser couver ou élever ses jeunes, il est alors indispensable de s’éloigner. De même, lors d’un survol le long d’une falaise, si un nid de branches est visible ou si un oiseau quitte la falaise et s’approche en vol direct, quittez rapidement le site.
Par contre voler avec un ou plusieurs rapaces loin de toute falaise ou de site potentiel de nidification est simplement un partage du moyen de propulsion, le thermique. Dans ce cas le dérangement est quasi absent et l’oiseau peut prendre le parapente comme un " OVNI ". Si vous ne cherchez pas à vous en approcher et ainsi montrer des signes d’agression cette rencontre ne posera pas de problème. Bien souvent l’oiseau, supérieur en vol au parapente, prendra rapidement la pompe et continuera son chemin.
Comme chez l’Homme, quelques rares individus se démarquent de leurs congénères. C’est le cas d’un couple d’aigles en Suisse et de quelques hardes de chamois sur Chamonix qui ont élu domicile à proximité de sites de décollages. Ces animaux se sont aujourd’hui habitués à la présence des parapentistes et lèvent à peine la tête lorsqu’ils sont survolés. Loin d’être des cas généralisables, ces observations restent exceptionnelles.
À l’opposé, un échec de nidification, par exemple chez le Gypaète barbu, est une catastrophe. En effet, en 2003, sur l’ensemble des Alpes, seuls 9 couples sont présents. Au vu des bons résultats du programme de réintroduction, on peut souhaiter que ce nombre augmente ces prochaines années. Pour cela, il faudra aussi que des sites de nidifications potentiels restent présents, sans dérangements…
Le vol libre représente une forme importante de liberté, que cette liberté profite aussi à la faune sauvage qui vie toute l’année dans des conditions extrêmes, et ne retrouve pas le soir, le réconfort d’un appartement douillet.